Firefox 3.6でスタートアップ時にTABが二つしか立ち上がらない原因は、IE Tabではなかった。
本当の原因はTab Mix Plusだった。

こ
こにある開発版のtab_mix_plus-0.3.8.3pre.100125.xpiをインストールしたら問題は解決した。

IE Tabもまともに動かないが、高機能版のCoral IE Tab
1.63.20091024であれば問題なく動く。

それにしても、いつの間に高機能版なんか出ていたのか。
知らなかった。。。